Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myod1P10085 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myod1P10085 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myod1P10085 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myod1P10085 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myod1P10085 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myod1P10085 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myod1P10085 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myod1P10085 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myod1P10085 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myod1P10085 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myod1P10085 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myod1P10085 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myod1P10085 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myod1P10085 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms