Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CatspereP0DP43 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CatspereP0DP43 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CatspereP0DP43 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CatspereP0DP43 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CatspereP0DP43 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms