Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pla2g4bP0C871 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pla2g4bP0C871 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pla2g4bP0C871 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pla2g4bP0C871 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pla2g4bP0C871 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pla2g4bP0C871 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms