Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa4P06798 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa4P06798 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa4P06798 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms