Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06329 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06329 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06329 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06329 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06329 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06329 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06329 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06329 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P06329 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06329 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06329 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06329 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06329 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06329 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06329 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06329 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06329 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06329 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06329 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06329 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06329 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06329 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06329 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06329 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06329 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06329 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06329 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06329 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06329 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06329 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06329 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06329 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06329 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06329 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06329 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06329 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06329 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P06329 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06329 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06329 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06329 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06329 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06329 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06329 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06329 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06329 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06329 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06329 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06329 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06329 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06329 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06329 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06329 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06329 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06329 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06329 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06329 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06329 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06329 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06329 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06329 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06329 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06329 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06329 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P06329 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06329 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06329 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06329 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06329 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06329 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06329 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06329 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06329 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06329 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06329 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms