Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myl1P05977 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Myl1P05977 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myl1P05977 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myl1P05977 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myl1P05977 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myl1P05977 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myl1P05977 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myl1P05977 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myl1P05977 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myl1P05977 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myl1P05977 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myl1P05977 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myl1P05977 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Myl1P05977 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myl1P05977 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Myl1P05977 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms