Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XlrP05531 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XlrP05531 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XlrP05531 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XlrP05531 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XlrP05531 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XlrP05531 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XlrP05531 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XlrP05531 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XlrP05531 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XlrP05531 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XlrP05531 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XlrP05531 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XlrP05531 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XlrP05531 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XlrP05531 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XlrP05531 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XlrP05531 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XlrP05531 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XlrP05531 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XlrP05531 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XlrP05531 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XlrP05531 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XlrP05531 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XlrP05531 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XlrP05531 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
XlrP05531 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XlrP05531 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XlrP05531 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XlrP05531 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XlrP05531 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XlrP05531 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XlrP05531 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XlrP05531 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XlrP05531 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XlrP05531 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XlrP05531 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XlrP05531 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XlrP05531 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XlrP05531 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XlrP05531 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XlrP05531 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XlrP05531 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XlrP05531 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XlrP05531 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XlrP05531 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XlrP05531 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XlrP05531 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XlrP05531 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XlrP05531 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XlrP05531 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XlrP05531 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XlrP05531 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XlrP05531 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XlrP05531 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XlrP05531 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XlrP05531 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XlrP05531 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XlrP05531 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XlrP05531 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XlrP05531 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XlrP05531 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XlrP05531 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XlrP05531 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XlrP05531 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XlrP05531 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XlrP05531 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XlrP05531 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XlrP05531 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XlrP05531 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XlrP05531 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XlrP05531 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XlrP05531 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XlrP05531 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XlrP05531 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XlrP05531 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XlrP05531 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XlrP05531 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XlrP05531 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XlrP05531 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XlrP05531 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XlrP05531 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XlrP05531 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XlrP05531 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XlrP05531 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XlrP05531 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XlrP05531 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XlrP05531 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XlrP05531 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XlrP05531 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XlrP05531 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XlrP05531 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XlrP05531 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XlrP05531 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XlrP05531 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XlrP05531 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XlrP05531 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XlrP05531 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XlrP05531 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XlrP05531 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms