Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col4a1P02463 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Col4a1P02463 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a1P02463 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a1P02463 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col4a1P02463 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col4a1P02463 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col4a1P02463 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col4a1P02463 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a1P02463 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col4a1P02463 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms