Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01747 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01747 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01747 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01747 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01747 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01747 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01747 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01747 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01747 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01747 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01747 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01747 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01747 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01747 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01747 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01747 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01747 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01747 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01747 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01747 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01747 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01747 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01747 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01747 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01747 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01747 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01747 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01747 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01747 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01747 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01747 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01747 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01747 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01747 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01747 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01747 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01747 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01747 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01747 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01747 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01747 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01747 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01747 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01747 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01747 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01747 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01747 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01747 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01747 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01747 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01747 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01747 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01747 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01747 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01747 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01747 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01747 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01747 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01747 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01747 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P01747 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01747 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01747 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01747 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01747 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01747 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01747 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01747 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01747 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01747 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01747 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01747 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01747 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01747 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01747 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01747 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01747 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01747 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01747 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01747 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01747 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01747 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01747 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01747 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01747 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01747 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01747 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01747 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01747 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01747 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01747 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01747 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms