Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01667 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01667 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01667 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01667 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01667 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01667 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01667 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01667 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01667 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01667 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01667 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01667 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01667 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01667 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01667 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01667 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01667 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01667 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01667 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01667 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01667 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01667 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01667 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01667 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01667 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01667 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01667 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01667 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01667 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01667 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01667 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01667 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01667 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01667 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01667 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01667 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01667 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P01667 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01667 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01667 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01667 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01667 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P01667 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01667 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01667 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01667 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01667 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
P01667 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
P01667 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
P01667 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01667 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01667 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P01667 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01667 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01667 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01667 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01667 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01667 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01667 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01667 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01667 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01667 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01667 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01667 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01667 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01667 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01667 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01667 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01667 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01667 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01667 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01667 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01667 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01667 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01667 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01667 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01667 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01667 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01667 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01667 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01667 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01667 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01667 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01667 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01667 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01667 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01667 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01667 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01667 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01667 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01667 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01667 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.2 ms