Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopeO89079 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CopeO89079 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CopeO89079 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CopeO89079 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CopeO89079 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CopeO89079 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CopeO89079 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CopeO89079 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CopeO89079 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CopeO89079 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CopeO89079 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopeO89079 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopeO89079 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopeO89079 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CopeO89079 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopeO89079 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopeO89079 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopeO89079 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CopeO89079 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CopeO89079 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CopeO89079 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CopeO89079 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CopeO89079 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CopeO89079 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CopeO89079 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CopeO89079 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CopeO89079 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CopeO89079 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CopeO89079 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CopeO89079 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CopeO89079 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CopeO89079 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CopeO89079 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CopeO89079 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CopeO89079 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CopeO89079 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CopeO89079 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CopeO89079 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CopeO89079 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopeO89079 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopeO89079 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopeO89079 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopeO89079 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CopeO89079 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CopeO89079 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CopeO89079 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CopeO89079 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CopeO89079 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CopeO89079 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CopeO89079 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CopeO89079 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CopeO89079 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CopeO89079 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopeO89079 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopeO89079 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopeO89079 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CopeO89079 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CopeO89079 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CopeO89079 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopeO89079 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopeO89079 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopeO89079 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CopeO89079 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopeO89079 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopeO89079 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopeO89079 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CopeO89079 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CopeO89079 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CopeO89079 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CopeO89079 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CopeO89079 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CopeO89079 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CopeO89079 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CopeO89079 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CopeO89079 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CopeO89079 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CopeO89079 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CopeO89079 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CopeO89079 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CopeO89079 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CopeO89079 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopeO89079 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopeO89079 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopeO89079 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopeO89079 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopeO89079 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CopeO89079 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CopeO89079 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CopeO89079 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CopeO89079 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CopeO89079 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CopeO89079 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CopeO89079 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CopeO89079 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CopeO89079 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CopeO89079 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CopeO89079 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CopeO89079 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CopeO89079 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms