Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GcatO88986 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GcatO88986 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcatO88986 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcatO88986 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcatO88986 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GcatO88986 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GcatO88986 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GcatO88986 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GcatO88986 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GcatO88986 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GcatO88986 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GcatO88986 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GcatO88986 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcatO88986 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcatO88986 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcatO88986 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcatO88986 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcatO88986 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcatO88986 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GcatO88986 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GcatO88986 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GcatO88986 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GcatO88986 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GcatO88986 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GcatO88986 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcatO88986 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcatO88986 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcatO88986 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcatO88986 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcatO88986 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcatO88986 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcatO88986 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcatO88986 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcatO88986 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcatO88986 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcatO88986 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcatO88986 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcatO88986 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GcatO88986 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcatO88986 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcatO88986 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcatO88986 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcatO88986 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcatO88986 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcatO88986 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcatO88986 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcatO88986 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcatO88986 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcatO88986 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcatO88986 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcatO88986 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcatO88986 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcatO88986 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GcatO88986 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GcatO88986 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcatO88986 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcatO88986 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcatO88986 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcatO88986 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcatO88986 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcatO88986 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcatO88986 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcatO88986 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcatO88986 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcatO88986 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcatO88986 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GcatO88986 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcatO88986 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GcatO88986 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcatO88986 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcatO88986 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcatO88986 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcatO88986 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GcatO88986 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GcatO88986 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcatO88986 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcatO88986 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcatO88986 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcatO88986 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GcatO88986 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GcatO88986 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GcatO88986 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GcatO88986 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms