Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BlmO88700 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BlmO88700 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
BlmO88700 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BlmO88700 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BlmO88700 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BlmO88700 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
BlmO88700 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BlmO88700 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BlmO88700 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BlmO88700 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BlmO88700 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BlmO88700 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BlmO88700 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
BlmO88700 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BlmO88700 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BlmO88700 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BlmO88700 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BlmO88700 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
BlmO88700 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BlmO88700 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BlmO88700 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BlmO88700 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BlmO88700 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BlmO88700 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BlmO88700 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BlmO88700 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BlmO88700 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
BlmO88700 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
BlmO88700 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BlmO88700 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
BlmO88700 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
BlmO88700 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
BlmO88700 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
BlmO88700 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
BlmO88700 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
BlmO88700 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
BlmO88700 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BlmO88700 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BlmO88700 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BlmO88700 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BlmO88700 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
BlmO88700 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
BlmO88700 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
BlmO88700 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
BlmO88700 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BlmO88700 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BlmO88700 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
BlmO88700 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
BlmO88700 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BlmO88700 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
BlmO88700 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BlmO88700 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BlmO88700 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BlmO88700 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BlmO88700 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
BlmO88700 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
BlmO88700 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BlmO88700 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BlmO88700 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
BlmO88700 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
BlmO88700 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
BlmO88700 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BlmO88700 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BlmO88700 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BlmO88700 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BlmO88700 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BlmO88700 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BlmO88700 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BlmO88700 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BlmO88700 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BlmO88700 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BlmO88700 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BlmO88700 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
BlmO88700 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BlmO88700 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BlmO88700 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
BlmO88700 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BlmO88700 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BlmO88700 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BlmO88700 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BlmO88700 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BlmO88700 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BlmO88700 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BlmO88700 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BlmO88700 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BlmO88700 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BlmO88700 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BlmO88700 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BlmO88700 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BlmO88700 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BlmO88700 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
BlmO88700 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
BlmO88700 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BlmO88700 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
BlmO88700 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
BlmO88700 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BlmO88700 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BlmO88700 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BlmO88700 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms