Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dll3O88516 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dll3O88516 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dll3O88516 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dll3O88516 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dll3O88516 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dll3O88516 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dll3O88516 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dll3O88516 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dll3O88516 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dll3O88516 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dll3O88516 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dll3O88516 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dll3O88516 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dll3O88516 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dll3O88516 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dll3O88516 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dll3O88516 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms