Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm10509O88255 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10509O88255 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10509O88255 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10509O88255 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms