Protein–RNA interactions for Protein: O70494

Sp3, Transcription factor Sp3, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp3O70494 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp3O70494 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp3O70494 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp3O70494 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp3O70494 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp3O70494 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp3O70494 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp3O70494 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sp3O70494 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp3O70494 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp3O70494 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp3O70494 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp3O70494 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp3O70494 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp3O70494 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp3O70494 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp3O70494 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp3O70494 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms