Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pknox1O70477 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox1O70477 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox1O70477 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms