Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CtssO70370 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtssO70370 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtssO70370 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CtssO70370 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtssO70370 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CtssO70370 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtssO70370 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtssO70370 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtssO70370 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtssO70370 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtssO70370 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtssO70370 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CtssO70370 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CtssO70370 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtssO70370 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CtssO70370 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CtssO70370 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtssO70370 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtssO70370 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtssO70370 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CtssO70370 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtssO70370 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtssO70370 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtssO70370 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtssO70370 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtssO70370 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtssO70370 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtssO70370 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtssO70370 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtssO70370 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtssO70370 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtssO70370 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtssO70370 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CtssO70370 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtssO70370 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtssO70370 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtssO70370 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtssO70370 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtssO70370 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtssO70370 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CtssO70370 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtssO70370 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtssO70370 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CtssO70370 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CtssO70370 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtssO70370 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtssO70370 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtssO70370 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtssO70370 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtssO70370 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtssO70370 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtssO70370 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtssO70370 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtssO70370 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtssO70370 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtssO70370 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtssO70370 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtssO70370 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtssO70370 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtssO70370 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtssO70370 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CtssO70370 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtssO70370 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtssO70370 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtssO70370 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtssO70370 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtssO70370 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtssO70370 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtssO70370 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CtssO70370 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtssO70370 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtssO70370 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtssO70370 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtssO70370 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtssO70370 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtssO70370 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtssO70370 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtssO70370 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtssO70370 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtssO70370 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtssO70370 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CtssO70370 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtssO70370 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms