Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nptx2O70340 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nptx2O70340 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nptx2O70340 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nptx2O70340 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nptx2O70340 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms