Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxq1O70220 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxq1O70220 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxq1O70220 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Foxq1O70220 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxq1O70220 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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