Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sap18O55128 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sap18O55128 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sap18O55128 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sap18O55128 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sap18O55128 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sap18O55128 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sap18O55128 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sap18O55128 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sap18O55128 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sap18O55128 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sap18O55128 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sap18O55128 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sap18O55128 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Sap18O55128 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sap18O55128 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms