Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prom1O54990 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prom1O54990 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prom1O54990 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prom1O54990 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prom1O54990 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prom1O54990 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prom1O54990 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prom1O54990 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prom1O54990 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prom1O54990 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prom1O54990 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prom1O54990 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prom1O54990 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prom1O54990 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prom1O54990 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prom1O54990 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prom1O54990 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prom1O54990 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prom1O54990 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms