Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkaO54804 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkaO54804 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkaO54804 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkaO54804 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkaO54804 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkaO54804 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkaO54804 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChkaO54804 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChkaO54804 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkaO54804 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChkaO54804 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkaO54804 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChkaO54804 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkaO54804 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChkaO54804 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkaO54804 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms