Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Limk2O54785 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Limk2O54785 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Limk2O54785 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Limk2O54785 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Limk2O54785 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Limk2O54785 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Limk2O54785 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Limk2O54785 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limk2O54785 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limk2O54785 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Limk2O54785 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limk2O54785 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limk2O54785 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limk2O54785 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limk2O54785 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limk2O54785 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limk2O54785 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Limk2O54785 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limk2O54785 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Limk2O54785 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms