Protein–RNA interactions for Protein: O54774

Ap3d1, AP-3 complex subunit delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3d1O54774 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3d1O54774 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3d1O54774 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3d1O54774 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3d1O54774 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3d1O54774 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3d1O54774 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap3d1O54774 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3d1O54774 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3d1O54774 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ap3d1O54774 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3d1O54774 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms