Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NudcO35685 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NudcO35685 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NudcO35685 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NudcO35685 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NudcO35685 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NudcO35685 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NudcO35685 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NudcO35685 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NudcO35685 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NudcO35685 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NudcO35685 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NudcO35685 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NudcO35685 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NudcO35685 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NudcO35685 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NudcO35685 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NudcO35685 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NudcO35685 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NudcO35685 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NudcO35685 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NudcO35685 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NudcO35685 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NudcO35685 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NudcO35685 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NudcO35685 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NudcO35685 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NudcO35685 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NudcO35685 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NudcO35685 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NudcO35685 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NudcO35685 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NudcO35685 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NudcO35685 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NudcO35685 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NudcO35685 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NudcO35685 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NudcO35685 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NudcO35685 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NudcO35685 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NudcO35685 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NudcO35685 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NudcO35685 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NudcO35685 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NudcO35685 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NudcO35685 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NudcO35685 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NudcO35685 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NudcO35685 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NudcO35685 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NudcO35685 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NudcO35685 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NudcO35685 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NudcO35685 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NudcO35685 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NudcO35685 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NudcO35685 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NudcO35685 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NudcO35685 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NudcO35685 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NudcO35685 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NudcO35685 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NudcO35685 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NudcO35685 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NudcO35685 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NudcO35685 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NudcO35685 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NudcO35685 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NudcO35685 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NudcO35685 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NudcO35685 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NudcO35685 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NudcO35685 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NudcO35685 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NudcO35685 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NudcO35685 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NudcO35685 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NudcO35685 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NudcO35685 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NudcO35685 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NudcO35685 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NudcO35685 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NudcO35685 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NudcO35685 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NudcO35685 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NudcO35685 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NudcO35685 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NudcO35685 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NudcO35685 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NudcO35685 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NudcO35685 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NudcO35685 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms