Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ColqO35348 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ColqO35348 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ColqO35348 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ColqO35348 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ColqO35348 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ColqO35348 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ColqO35348 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ColqO35348 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ColqO35348 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ColqO35348 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ColqO35348 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ColqO35348 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ColqO35348 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ColqO35348 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ColqO35348 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ColqO35348 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ColqO35348 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ColqO35348 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ColqO35348 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ColqO35348 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ColqO35348 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ColqO35348 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ColqO35348 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ColqO35348 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ColqO35348 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ColqO35348 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ColqO35348 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ColqO35348 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ColqO35348 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ColqO35348 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ColqO35348 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ColqO35348 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ColqO35348 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ColqO35348 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ColqO35348 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ColqO35348 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ColqO35348 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ColqO35348 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ColqO35348 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ColqO35348 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ColqO35348 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ColqO35348 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ColqO35348 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ColqO35348 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ColqO35348 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ColqO35348 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ColqO35348 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ColqO35348 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ColqO35348 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ColqO35348 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms