Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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Slc18a3O35304 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Slc18a3O35304 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Slc18a3O35304 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Slc18a3O35304 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Slc18a3O35304 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Slc18a3O35304 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Slc18a3O35304 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Slc18a3O35304 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc18a3O35304 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Slc18a3O35304 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms