Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn4O35054 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn4O35054 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn4O35054 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn4O35054 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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