Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gata2O09100 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata2O09100 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata2O09100 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata2O09100 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata2O09100 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata2O09100 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata2O09100 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata2O09100 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata2O09100 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gata2O09100 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata2O09100 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata2O09100 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms