Protein–RNA interactions for Protein: O09009

Rfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase radical fringe, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfngO09009 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RfngO09009 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RfngO09009 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfngO09009 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfngO09009 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfngO09009 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfngO09009 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfngO09009 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfngO09009 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfngO09009 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfngO09009 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfngO09009 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RfngO09009 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RfngO09009 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RfngO09009 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RfngO09009 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfngO09009 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfngO09009 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfngO09009 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfngO09009 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfngO09009 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfngO09009 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RfngO09009 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RfngO09009 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RfngO09009 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RfngO09009 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RfngO09009 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfngO09009 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfngO09009 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfngO09009 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RfngO09009 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RfngO09009 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RfngO09009 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RfngO09009 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RfngO09009 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfngO09009 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfngO09009 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfngO09009 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfngO09009 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RfngO09009 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RfngO09009 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RfngO09009 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfngO09009 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfngO09009 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfngO09009 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfngO09009 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfngO09009 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfngO09009 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfngO09009 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfngO09009 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfngO09009 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RfngO09009 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RfngO09009 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RfngO09009 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RfngO09009 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RfngO09009 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RfngO09009 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RfngO09009 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfngO09009 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfngO09009 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfngO09009 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfngO09009 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfngO09009 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RfngO09009 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfngO09009 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfngO09009 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfngO09009 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfngO09009 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfngO09009 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfngO09009 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfngO09009 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfngO09009 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfngO09009 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfngO09009 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RfngO09009 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RfngO09009 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfngO09009 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms