Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IfnabL7MTU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IfnabL7MTU6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IfnabL7MTU6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IfnabL7MTU6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms