Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3402K7N5P2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3402K7N5P2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3402K7N5P2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3402K7N5P2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms