Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm19965J3QNY8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm19965J3QNY8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm19965J3QNY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm19965J3QNY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms