Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r34G3XA52 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r34G3XA52 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r34G3XA52 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r34G3XA52 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r34G3XA52 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r34G3XA52 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r34G3XA52 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r34G3XA52 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r34G3XA52 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r34G3XA52 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms