Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XntrpcF8VQM8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XntrpcF8VQM8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XntrpcF8VQM8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XntrpcF8VQM8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms