Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Usp32F8VPZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp32F8VPZ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Usp32F8VPZ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp32F8VPZ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Usp32F8VPZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp32F8VPZ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp32F8VPZ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms