Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh16f1E9Q9P8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh16f1E9Q9P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f1E9Q9P8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Rdh16f1E9Q9P8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Rdh16f1E9Q9P8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rdh16f1E9Q9P8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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