Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtproE9Q612 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtproE9Q612 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtproE9Q612 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtproE9Q612 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms