Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Setd2E9Q5F9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd2E9Q5F9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd2E9Q5F9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd2E9Q5F9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd2E9Q5F9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms