Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BC005561E9Q5E2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
BC005561E9Q5E2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
BC005561E9Q5E2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
BC005561E9Q5E2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BC005561E9Q5E2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BC005561E9Q5E2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BC005561E9Q5E2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms