Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pde8bE9Q4S1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde8bE9Q4S1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pde8bE9Q4S1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde8bE9Q4S1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pde8bE9Q4S1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde8bE9Q4S1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde8bE9Q4S1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms