Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930579F01RikE9Q3L6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930579F01RikE9Q3L6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930579F01RikE9Q3L6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930579F01RikE9Q3L6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms