Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b2E9Q3E1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b2E9Q3E1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aldh3b2E9Q3E1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms