Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r238E9Q373 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r238E9Q373 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r238E9Q373 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r238E9Q373 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r238E9Q373 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms