Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r88E9Q235 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r88E9Q235 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r88E9Q235 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r88E9Q235 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r88E9Q235 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r88E9Q235 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms