Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3250E9Q1M3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3250E9Q1M3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3250E9Q1M3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms