Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Myo5cE9Q1F5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Myo5cE9Q1F5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myo5cE9Q1F5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Myo5cE9Q1F5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Myo5cE9Q1F5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Myo5cE9Q1F5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo5cE9Q1F5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo5cE9Q1F5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo5cE9Q1F5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Myo5cE9Q1F5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Myo5cE9Q1F5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Myo5cE9Q1F5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Myo5cE9Q1F5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
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