Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E430018J23RikE9PZQ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E430018J23RikE9PZQ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E430018J23RikE9PZQ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms