Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Srp54bE9PXC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp54bE9PXC0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srp54bE9PXC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Srp54bE9PXC0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp54bE9PXC0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1445.7 ms